Le thème principal est l'étude de la dynamique de la matière organique, principal facteur de la fertilité naturelle des sols. Cet axe s'inscrit dans la nécessité mondiale d'augmenter les stocks de carbone organique dans les sols, à la fois pour lutter contre l'augmentation du CO2 atmosphérique – principale cause du changement climatique – et pour améliorer la fertilité des sols, qui est actuellement en déclin partout dans le monde, en particulier en Europe.
Nos travaux portent sur plusieurs aspects : (a) l'étude de la séquestration du C du sol (positive ou négative : gains ou pertes) suite à des changements d'usage : boisement de zones agricoles abandonnées, changements de pratiques agricoles, changements de pratiques sylvicoles, etc. ; (b) l'étude des stocks de C du sol à l'échelle régionale (Catalogne, Espagne) et leur relation avec les usages, la climatologie et le substrat géologique ; (c) la caractérisation de la matière organique du sol, d'un point de vue chimique et biochimique, et l'effet des changements d'usage et d'événements écologiques ponctuels (incendie) sur ces caractéristiques ; (d) l'obtention, la caractérisation et l'application d'engrais organiques (en particulier d'engrais humiques commerciaux), et la vérification de leur utilité en tant que biostimulants de la croissance des plantes.